동물을 사랑하는 쌍둥이 형제 라온과 가온. 그들의 앞에 지구의 어스 에너지를 노린 우주의 악당 다크 스피너가 나타난다. 라온과 가온은 정체를 알 수 없는 목소리를 따라서 동물원 지하의 지구 방위대 엔지너의 기지로 가게된다. 그 곳에서 메가 엔지너 레오와 이글을 만나고, 함께 지구를 위협하는 적에 맞서 싸우게 되는데.....
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